С 2012 по 2015 г. футболист выступал за юношеские и молодежные команды мадридского "Реала". На профессиональном уровне играл за испанские клубы "Мерида", "Фуэнлабрада", "Бадахос" и "Расинг".

В сезоне 2024/2025 годах Фернандес защищал цвета "Химок". Его последним клубом был греческий "Астерас", за который спортсмен сыграл 15 матчей.